MZmine MZmine — это расширенное приложение, разработанное на языке Java для пользователей, интересующихся обработкой данных масс-спектрометрии. Он обеспечивает чистый и интуитивно понятный интерфейс для контроля задач и управления проектами, а также модули, которые позволяют импортировать и обрабатывать необработанные данные, обнаруживать пики, идентифицировать и выравнивать списки, визуализировать и нормализовать. Анализ данных масс-спектрометрии в интерфейсе Java После загрузки архива вы можете разархивировать содержимое и дважды щелкнуть файл .bat, чтобы запустить приложение. Окно командной строки должно оставаться активным в фоновом режиме, чтобы иметь возможность работать с графическим интерфейсом. При запуске нового проекта вы можете настроить параметры и значения или импортировать их из внешних файлов в формате TXT или CSV. Для этой цели доступен пакетный режим, а также другие компоненты, такие как заполнение пропусков, обнаружение массы, фильтр дублирующихся пиков, онлайн-поиск в базе данных и предсказание формулы. Настройте параметры обнаружения пиков и исследуйте режимы визуализации Настройки обнаружения пиков можно настроить для массы, фильтра плечевых пиков FTMS, построителя хроматограммы, GridMass 2D, построителя списка пиков МС/МС или целевого режима. Когда дело доходит до режимов списка пиков, вы можете настроить параметры упорядочивания списков пиков, заполнения пробелов, изотопов, фильтрации, анализа данных, экспорта и импорта, среди прочего. Что касается визуализации, можно выбрать TIC/XIC, Spectra, 2D или 3D, МС/МС или визуализатор с нейтральными потерями. В вашем распоряжении также графики разброса, гистограммы и пиковой интенсивности. Предоставляется полная справочная документация. Комплексный инструмент для анализа данных масс-спектрометрии В наших тестах мы не сталкивались с проблемами совместимости с последней версией Java. MZmine безотказно работал на Windows 10 и незначительно потреблял системные ресурсы, без проблем отображая графики. Учитывая все аспекты, MZmine удобен для опытных пользователей, заинтересованных в анализе данных масс-спектрометрии с использованием утилиты на основе Java.Он бесплатный, с открытым исходным кодом и поставляется в комплекте с богатым набором практических функций. MSSpect — это бесплатная утилита с открытым исходным кодом для автоматического обнаружения пиков по спектрам МС и МС/МС. Он может работать с файлами данных, созданными с помощью ГХ/МС, ЖХ/МС или FTICR/МС, а также может выполнять преобразование между этими типами файлов. MSSpect поддерживает широкий спектр форматов файлов, включая форматы PIC и MGF, связанные с m-файлами большинства производителей приборов. Дет MZmine — это алгоритм обнаружения пиков и деизотопирования для рабочих процессов масс-спектрометрии в реальном времени. Основное внимание уделяется общему качеству результатов и скорости обработки. Он был вдохновлен популярным программным обеспечением XCMS, но расширен за счет добавления в список других алгоритмов деизотопирования. XCMS является широко популярным программным обеспечением, и многие инструменты деизотопии были созданы на его основе. Вы можете запустить MZmine из командной строки и в пакетном режиме. Вы также можете запустить его в режиме реального времени, в фоновом режиме (также в пакетном режиме) или как консольное приложение. MZmine позволяет загружать спектры из баз данных, импортировать файлы, строить хроматограммы, обнаруживать пики, деизотопировать, аннотировать пики и создавать отчеты. MZmine доступен для Windows, Mac OSX и Linux. MZmine — это алгоритм обнаружения пиков и деизотопирования для рабочих процессов масс-спектрометрии в реальном времени. Основное внимание уделяется общему качеству результатов и скорости обработки. Он был вдохновлен популярным программным обеспечением XCMS, но расширен за счет добавления в список других алгоритмов деизотопирования. XCMS является широко популярным программным обеспечением, и многие инструменты деизотопии были созданы на его основе. Вы можете запустить MZmine из командной строки и в пакетном режиме. Вы также можете запустить его в режиме реального времени, в фоновом режиме (также в пакетном режиме) или как консольное приложение. MZmine позволяет загружать спектры из баз данных, импортировать файлы, строить хроматограммы, обнаруживать пики, деизотопировать, аннотировать пики и создавать отчеты. MZmine доступен для Windows, Mac OSX и Linux. MZmine — это алгоритм обнаружения пиков и деизотопирования для рабочих процессов масс-спектрометрии в реальном времени. Основное внимание уделяется общему качеству результатов и скорости обработки. Он был вдохновлен популярным программным обеспечением XCMS, но расширен за счет добавления в список других алгоритмов деизотопирования. XCMS является широко популярным программным обеспечением, и многие инструменты деизотопии были созданы на его основе. Вы можете запустить MZmine из командной строки и в пакетном режиме.Вы также можете запустить его в режиме реального времени, в фоновом режиме (также в пакетном режиме) или как консольное приложение. MZmine позволяет загружать спектры из баз данных, импортировать файлы, строить хроматограммы, обнаруживать пики, деизотопировать, аннотировать пики и создавать отчеты. М fb6ded4ff2
Related links:
Comments